1986年7月19日，内蒙古大学实验动物研究中心成立。该中心是自治区第一座国家标准化实验动物的繁育基地。
内蒙古大学实验动物研究中心是已故中国工程院院士旭日干教授建立的自治区最早的实验动物生产基地。根据内蒙古自治区在家畜资源上的优势，在国内率先开展了以家畜体外受精技术为中心的哺乳动物繁殖生物学及繁殖生物技术的研究。
内蒙古大学实验动物研究中心目前是教育部哺乳动物生殖生物学及生物技术重点实验室、国家转基因动物技术研究中心建设单位、内蒙古自治区哺乳动物生殖生物学及生物技术省部共建国家重点实验室培育基地，同时也是动物学国家重点学科、国家“211工程”重点建设学科和内蒙古自治区生殖生物学重点学科，现为内蒙古大学动物学硕士、博士学位授权点，博士后流动站，具有长江学者计划特聘教授岗位。
该中心成立以来，成功培育出世界首例能产生ω-3脂肪酸的转基因克隆牛和一批优质品种肉牛、转基因克隆绒山羊、体细胞克隆绒山羊；在国内率先开展绵羊精原干细胞移植研究，成功繁育了供体公绵羊的后代，为自治区医学、生命科学等科学研究事业的发展奠定了坚实的基础、提供了重要支撑条件，为自治区经济社会发展作出了重要贡献。
